《美国囧案》第二季延续第一季的伪纪录片风格，将镜头对准一所天主教高中。纪录片工作者Peter Maldonado和Sam Ecklund收到新委托，调查一起校园恶作剧：食堂的柠檬水被掺入泻药，导致数十名学生集体腹泻。事件发生后，学校陷入混乱，学生们互相猜忌，校方急于找出肇事者。Peter和Sam逐一走访学生、教师和校方人员，试图还原事件真相。他们发现每个嫌疑人都有动机和秘密，调查过程充满反转与笑料。与此同时，两人也面临来自校方的压力，以及自身对真相的执着与困惑。本季通过荒诞的校园闹剧，探讨了真相、正义与青少年成长等主题。