《X战警97第一季》是90年代经典动画的正式续集，故事紧接X教授遇袭后的时间线。万磁王依照X教授遗愿，接管泽维尔天才少年学校并领导X战警。在人类对变种人敌意日益加深的世界里，镭射眼、琴·葛蕾、暴风女、金刚狼、野兽、牌皇、罗刹女等熟悉成员悉数回归，同时全新角色陆续加盟。本季核心冲突围绕万磁王的激进立场与X战警传统和平理念的碰撞展开。万磁王试图以更强硬手段保护变种人，引发团队内部信任危机。与此同时，人类势力利用哨兵机器人展开追杀，惊恶先生暗中策划阴谋，变种人抵抗组织浮出水面。剧集延续经典画风与叙事节奏，深入探讨仇恨、偏见与身份认同主题，并引入全新角色推动剧情发展，为后续故事埋下重要伏笔。